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艾德莱RNA提取产品选择指南20151230   点击次数:14737次

北京艾德莱生物RNA提取产品选择指南
首先询问客户提取的大致种类,是动物组织细胞?植物?血液样品?真菌?细菌?病毒?酵母?不同的种类应该选择不同的产品。
 
动物组织细胞
(1)       RN01 TRIpure reagent,这个就是InvitrogenTRIzol,我们质量完全和进口一样可以100%替代进口TRIzol
(2)       RN04 RNA提取试剂盒。这款就是TRIzol,只是把TRIzol配套使用的氯仿,异丙醇,70%乙醇,DEPC处理的水和配全了。等于是TRIpureRN01)加氯仿,异丙醇,70%乙醇,DEPC处理的水。该款产品用的人很少,因为大部分实验室肯定是有这些常见的试剂的,不需要买公司的。
(3)       RN03 RNApure 超纯总RNA快速提取试剂盒。这个等于是TRIzol加离心柱子(和天根的DP419完全一样),在TRIzol的基础上加了离心柱子,速度更快,纯度更高,操作更简单。等于是TRIpureRN01)加离心柱子。
(4)       RN07 EASYspin组织/细胞RNA快速提取试剂盒。这款等于是Qiagen74104完全一样,它的优点在于不用苯酚,氯仿等毒性物质,速度最快,但是残留DNA可能稍多,必要时候还可能要用DNA酶消化。
(5)       RN28 EASYspin Plus组织/细胞RNA快速提取试剂盒。这款等于是Qiagen74134完全一样,是目前世界上最先进的试剂盒。15分钟提取,不用苯酚,氯仿,也不残留DNA,不用DNA酶消化直接可以做荧光定量PCR,价格只有Qiagen同类产品的四分之一。目前国内就我们一家能做,天根没有此产品。天根的DP431理论上是对应这个产品的,但是天根的需要DNA酶消化,时间长,步骤繁琐,还容易降解RNA
 
动物组织细胞RNA提取的总结:
1.       首先推荐就是RN28 EASYspin Plus组织/细胞RNA快速提取试剂盒。
2.       客户觉得RN28贵,或者客户习惯用天根的DP419就推RN03 Trizol+离心柱,等于天根DP419)
3.       就是想替换invitrogenTRIzol或者其它公司的Trizol,就推RN01。我们Trizol承诺肯定是第一的。
4.       想替换Qiagen74104,就推RN07。也可以建议我们有升级版本的Qiagen74104,就是等于Qiagen74134的更好的RN28可以选择, RN07要加DNA消化才不残留基因组DNARN28不用另外DNA酶消化了。
5.       如果用的天根的DP431, 可以推荐用RN28替换(RN28比天根这款更快速简单,天根需要DNA酶消化,时间长,步骤繁琐,还容易降解RNA,我们的一根基因组DNA清除柱子,一分钟清除掉基因组DNA
注意:我们的RNA提取技术国内第一,刚才提到的任何一个产品,我们都可以保证质量达到和进口水平一样,Qiagen,天根,omega,等任何一家公司的同类产品能做的,我们不能做到效果一致,或者更好,无条件退。
但是也要注意,如果客户的样品特殊导致的提取产量低或者提取失败那不是我们的问题,进口的和天根也提取失败了,那就不是我们的问题。专业知识不熟悉的业务员千万不要保证任何样品任何情况都100%提取,只能保证任何样品只要别家公司能提取的,我们就一定能提取,而且肯定只好不坏。
 
心脏、骨骼肌、血管、气管、食管、眼球、皮肤、耳朵等纤维丰富组织
选择RN44 EASYspin 纤维类组织RNA快速提取试剂盒, 适用于快速提取心脏、骨骼肌、血管、气管、皮肤和其它纤维丰富的组织RNA ,相当于qiagen74704
   
植物
植物千变万化,种类繁多,非常复杂,世界上任何一家公司任何一种试剂盒也无法确保100%提取成功。因此选择推荐植物RNA提取试剂盒必须多和客户,技术人员沟通。
A: TRIzol可以提取的植物样品
首先询问客户的样品是否曾经用别的试剂或者试剂盒提取过的植物样品,TRIzol是否可以提取成功?如果TRIzol可以提取成功的样品:
(1)       首先有两种选择:第一是用我们的RN01 TRIpure reagent,这个就是InvitrogenTRIzol,我们质量完全和进口一样可以100%替代进口TRIzol第二是用RN33 PLANTpure 通用植物总RNA快速提取试剂盒(普通植物组织细胞),这个试剂盒的原理,成分和RN03完全一样,也是TRIzol加离心柱子,在TRIzol的基础上加了离心柱子,速度更快,纯度更高,操作更简单。等于是TRIpureRN01)加离心柱子。
(2)       然后根据客户的特殊具体需求比如想速度更快,操作更简单,还不想用TRIzol这种苯酚,氯仿毒性物质的客户还有两种选择:一种选择是RN52 EASYspin通用植物RNA提取试剂盒,这个盒子和天根的DP432 RNAprep pure植物总RNA提取试剂盒一样,不用苯酚,氯仿,速度最快,操作最简单,带DNA酶柱上消化,得到的RNA可以直接做荧光定量PCR可以提取包括水稻、玉米、小麦、拟南芥、番茄、烟草和棉花等多糖多酚少的简单植物样品。比天根的优点在于适应性更广泛,纯度更高。另外一种是选择RN09 EASYspin植物RNA提取试剂盒,这个试剂盒是不带DNA酶柱上消化的,和qiagen74904 RNeasy plant mini kit 一样,但是本试剂盒适应性更广泛,一般多糖多酚的如冬青,梅花,杨树,月季,玫瑰,茶花也都可以提取,但是不带DNA酶柱上消化,更适合只做普通的反转录和克隆。如果知道用户使用天根的DP432,全式金的ER301-01则对应我们的RN52,如用户使用qiagen74904对应我们RN09
 
B: TRIzol无法提取的植物样品
如果客户说,他们曾经用过TRIzol,但是TRIzol无法提取成功,或者没有用过TRIzol,但是知道TRIzol无法提取成功的样品,说明是比较复杂的多糖多酚的样品,那么RN01,RN33trizol原理的是肯定不行了。别无选择只有三个可能推荐:
(1)       叶片、花瓣、花芽类比较叶片类的种类包括象葡萄叶子,杨树叶子,棉花叶片类类代谢产物多酚丰富的种类相对简单,可以用RN38 EASYspin Plus植物RNA提取试剂盒提取(RN38RN09的升级版,加了一根基因组DNA清除柱子,一般可以清除DNA到电泳肉眼不可见),如果RN38提取产量低,可以用RN38的同一个盒子按照RN09的步骤提取可能提高产量(略去基因组清除柱步骤可能提高产量);如果RN38或者RN09提取残留肉眼可见的基因组DNA,可以按照RN09步骤提取并加一个DNA酶柱上消化的步骤(货号:RN34)来清除残留DNA
(2)        如稻谷种子,百合鳞茎,葡萄果实,唐菖蒲的球茎,中草药块根等复杂多糖多酚色素淀粉含量特别大,这一类很难提取,只能尝试RN53 EASYspin Plus多糖多酚/复杂植物RNA提取试剂盒
(3)        其它公司试剂盒已经提取失败或者产量低的复杂植物,首先尝试RN53 EASYspin Plus多糖多酚/复杂植物RNA提取试剂盒。例如天根的DP441多糖多酚植物总RNA提取试剂盒提取失败的或者要替换天根DP441
 总结:我们公司是植物RNA提取的世界第一,市面上所有公司的所有产品,我们都能有更好的对应,而且,我们还有很多独特的申请了专利的植物RNA提取试剂盒,包括各种公司提取失败的样品,如Qiagen提取失败的黑加仑,冬青,葡萄果实等等都可以做。要强调其它公司只是营销,我们可以拿出100多篇发表文章的PDF原文给客户看,其中大量的样品是其它公司提取失败的样品。而且,我们应用质量很好,可以用于芯片,miRNA测序,建库,RACE等各种要求高的下游应用。
客户部分成功样品列表(还在不断增长中):棉花、海棠、黑加仑、烟草、拟南芥、虎杖、大豆、草莓、冬青、月季花雌蕊、蔷薇、沙棘、冬枣、芦荟、仙人掌、报春花、水稻、玉米、唐菖蒲、樱桃、白玉兰、毛白杨、樱花、葡萄、百合花、百合叶子雌蕊雄蕊、紫菜、绿藻、香蕉、水仙花、青花菜、地被菊、苹果、梅花、番茄、石斛、毛桃、苎麻、慈姑、葛根、甘肃桃、玫瑰花、槟榔果、甜糖菊、硅藻、牡丹、胡杨、油桐果、梨子皮、板栗花序、青皮云杉、红树根、铁线蕨、黄瓜、小麦叶子种子、番木瓜、甘薯、紫薯、油松、油茶、马尾松、芜菁、毛果杨、木薯、大叶落地生根、山杏、旱柳、桉树、琵琶花果、麻风树,沙生槐、荞麦。
发表文章100多篇,请参考后面发表文章列表。
真菌样品
如果是丝状真菌,选择是RN09 EASYspin植物RNA提取试剂盒,没错,真菌就是用RN09植物RNA提取的盒子来提取的。这个盒子RN09和Qiagen的74904 RNeasy plant mini kit完全一样。客户要搞不清楚就下原版qiagen的说明书看看就行了,确保RN09和Qiagen的74904一样。如果客户是不太清楚是哪种真菌,为了保险起见,现在提取真菌也推荐用RN38!首选RN38!
下面是Qiagen网站的74904的介绍:
RNeasy Plant Mini Kit
从植物和真菌中纯化多达100 ug总RNA
30分钟即可获得高品质的总RNA
无需酚/氯仿抽提
无需氯化铯梯度离心,无需氯化锂或乙醇沉淀
出色的RNA回收率
即用型RNA适合各种下游应用
 
 
血液样品
A: 无保护直接冻存血液(血液RNA保存的时候,一定要先处理了才保存,直接把抗凝血液冻到负80冰箱,RNA肯定降解,至少部分降解。)
提取冻存的血液RNA的时候,你没有太多选择,只有选择RN23 RNAliquid 超速全血(液体样本)总RNA提取试剂盒,因为你不可以先融解冻血,然后再裂解红细胞,因为细胞冰冻后已经受损破裂,RNA酶释放出来了,这个时候,不能裂解红细胞再去折腾了,必须使用可以直接裂解全血的裂解液,乘RNA酶还没有完全降解RNA的时候,就抑制住RNA酶,然后往下面提取。

B:
新鲜的血液
(4)       可以选择RN25 RNAblood 超纯全血总RNA快速提取试剂盒,这个原理就是先红细胞裂解液裂解红细胞得到白细胞,然后Trizol(TRIpure)裂解白细胞,最后离心柱子漂洗。
(5)       也可以用RN23 RNAliquid 超速全血(液体样本)总RNA提取试剂盒。
(6)       RN06 EASYspin 全血RNA快速提取,这款和Qiagenqiaamp blood RNA KIT一样,优点是不用苯酚,氯仿(trizol)毒性物质。缺点是残留DNA多,还要加DNA酶消化,如果RNA做荧光定量PCR,不推荐这款。
(7)       最后,你经费特别紧张,也可以选择RN23的不用离心柱的版本。RN02 TRIpure LS ReagentLS就是liquid sample的意思,液体样品RNA提取试剂,就是专门提取液体样品的TRIzol版本。这个缺点就是不用离心柱子纯度差一点(当然一般不影响试验结果),繁琐一点,对操作技术的要求高一点,样品量太小也不适合。
 
总结:如果是新鲜血样品,首先推荐RN25 RNAblood 超纯全血总RNA快速提取试剂盒或者RN23 RNAliquid 超速全血(液体样本)总RNA提取试剂盒;如果你是冰冻血,别无选择,只有推荐RN23 RNAliquid 超速全血(液体样本)总RNA提取试剂盒;需要处理,运输,保存血液样品后再提取也是推荐RN23 RNAliquid 超速全血(液体样本)总RNA提取试剂盒。
 
酵母样品
RN10 EASYspin酵母RNA快速提取试剂盒,不用苯酚,氯仿毒性物质,快速简单。
细菌样品
RN08 EASYspin细菌RNA快速提取试剂盒,不用苯酚,氯仿毒性物质,快速简单。
病毒样品(从血浆,血清,体液等无细胞体系)
RN27 病毒RNA快速提取试剂盒
RN22-病毒基因组DNA/RNA快速提取试剂盒
从同一个样品里面同时提取RNA、DNA
RN29 ALLprep 组织细胞RNA/DNA分提试剂盒。这个等于是Qiagen的80204 AllPrep DNA/RNA Mini Kit完全一样。
从同一个样品里面同时提取RNA、DNA、protein蛋白
RN36 ALLprep 组织细胞RNA/DNA/Protein分提试剂盒。这个等于是Qiagen的80004 AllPrep DNA/RNA/protein Mini Kit完全一样。
从同一个样品里面同时提取RNA、microRNA、DNA、protein蛋白
RN47 Allprep RNA/DNA/miRNA/protein分提试剂盒 
从同一个样品里面同时提取RNA、microRNA、DNA
RN48 Allprep RNA/DNA/miRNA分提试剂盒
 
总结:任何从一个样品里面同时提取RNA,DNA,蛋白或者任意组合的客户都可以做。
 
MicroRNA提取选择指南
1. 从组织细胞中提取microRNA。首选RN05 RNAmisi microRNA提取试剂盒,这个和qiagen的miRNeasy Mini kit (qiagen的货号:217004 )完全相同。而且,我们配了富集microRNA的,比qiagen的还要方便,Qiagen如果需要富集microRNA,还要另外购买吸附柱子。一个盒子,既可以提取包括microRNA,28s,18s,mRNA的总RNA,也可以单独提取富集的microRNA。质量确保200%和qiagen的一样,否则,无条件退货,赔钱。qiagen的目录价格是3710 50次。我们价格只有qiagen的三分之一。
2. 从全血,液体样品,血浆,血清中提取microRNA。首选RN24 BLOODmisi全血(液体样品)microRNA快速提取试剂盒。此试剂盒在qiagen和ambion的上述组织细胞RNA提取试剂盒上面改进而成。为我们独创,qiagen和进口公司也没有。是最快速方便的提取血液microRNA的产品。
如果仅仅是从血浆/血清中提取microRNA,应该选择RN4601 血清/血浆microRNA快速提取试剂盒。
3. 从石蜡包埋组织提取microRNA。首选RN31 EASYspin 石蜡包埋组织microRNA快速提取试剂盒。该款试剂盒原理,方法,基本和qiagen的一致。对应qiagen产品是miRNeasy FFPE Kit,货号是:217504。
4. 从植物中提取microRNA。一般来说,如果TRIzol可以提取的植物样品,首选RN05 RNAmisi microRNA提取试剂盒。TRIzol无法提取的样品,应该首选RN40 EASYspin植物microRNA快速提取试剂盒,为本公司独创产品。
 
附录:Trizol提取microRNA,因为Trizol无法沉淀很多microRNA,丢失很多,造成文章被质疑撤回。

Molecular Cell, Volume 43, Issue 6, 1005-1014, 16 September 2011 doi:10.1016/j.molcel.2011.07.031

RETRACTED: Cell Adhesion-Dependent Control of MicroRNA Decay

Young-Kook Kim1, Jinah Yeo1, Minju Ha1, Boseon Kim1 and V. Narry Kim1, 2, ,  

1 School of Biological Sciences, Seoul National University, Seoul 151-742, Korea
2 Bioinformatics Institute, Seoul National University, Seoul 151-742, Korea

Corresponding author

This article has been retracted: please see Elsevier Policy on Article Withdrawal (http://www.elsevier.com/locate/withdrawalpolicy).This article has been retracted at the request of the Editor-in-Chief and Author.In this paper, we reported that the levels of specific microRNAs (miRNAs) decrease when cells are grown at low density or when cells are detached from a culture dish. Based on our results, we proposed that some miRNAs are selectively destabilized depending on the adhesion status of the cells. However, in subsequent studies, we discovered that structured miRNAs with low GC content are selectively lost during sample preparation, particularly when a small number of cells is used for RNA preparation using the standard TRIzol protocol (see the Letter to the Editor published in this issue for details). These findings provide
     
 
 
 
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